Anna, seorang gadis pemalu berusia 12 tahun, dikirim untuk menghabiskan waktu bersama bibi dan pamannya yang tinggal di pedesaan, di mana dia bertemu Marnie . Keduanya menjadi sahabat . Namun lambat laun Anna menyadari bahwa Marnie tidak seperti yang terlihat. Seorang gadis berusia 12 tahun dikirim ke pedesaan karena alasan kesehatan, di mana dia bertemu dengan teman yang tidak terduga dalam bentuk Marnie, seorang gadis muda dengan rambut pirang panjang tergerai . Saat persahabatannya terurai, ada kemungkinan Marnie semakin dekat harapkan . —David Aktif Anna yang berusia dua belas tahun percaya bahwa dia berada di luar lingkaran sihir tak kasat mata yang dimiliki kebanyakan orang, dan menutup diri dari semua orang di sekitarnya . Prihatin dengan kesehatannya, ibu angkat Anna memutuskan untuk mengirimnya ke pedesaan Hokkaido untuk tinggal di sebuah laut . Di sana dia bertemu Marnie, seorang gadis muda energik yang muncul entah dari mana . Pasangan itu dengan cepat menjadi tak terpisahkan . Anna, seorang anak berusia 12 tahun yang kreatif dan merasa terisolasi dari semua orang di sekitarnya, meninggalkan Sapporo untuk menghabiskan liburan musim panas bersama kerabat ibunya di kota tepi pantai Kissakibetsu .

Di sana, siswi sekolah yang sakit dan canggung secara sosial menemukan Marsh yang sepi.Rumah di seberang pantai, tempat Anna melihat Marnie, seorang gadis pirang penuh teka-teki yang merindukan persahabatan dan persahabatan . Sedikit demi sedikit, ikatan mendalam yang misterius antara kedua wanita muda itu terbentuk, mengaburkan batas-batas halus antara kenyataan dan fantasi . Tapi Annaharus tahu . Siapakah Gadis di Jendela Biru, penghuni rumah tua yang misterius dan menawan?—Nick Riganas Anna Sasaki adalah seorang gadis introvert berusia 12 tahun yang tinggal di Sapporo bersama orang tua angkatnya, Yoriko dan suaminya . Anna menjauh dan tidak senang dengan mereka, karena dia mengetahui bahwa mereka dibayar oleh pemerintah untuk merawatnya tetapi akan melakukannya meninggalkan orang tua asuhnya yang bingung dan khawatir dengan perilakunya . Suatu hari di sekolah, dia pingsan karena serangan asma dan orang tuanya mengirimnya untuk menghabiskan musim panas bersama Setsu dan Kiyomasa Oiwa, kerabat Yoriko, di pedesaan, kota tepi pantai di mana udara terletak di antara Kushiro dan Nemuro . Anna melihat sebuah rumah besar yang terbengkalai, bobrok dan ditumbuhi tanaman, melintasi rawa asin dan menyeberangi rawa untuk menyelidikinya .

Dia melihat sekeliling, bertanya-tanya mengapa rumah itu tampak begitu familiar baginya, namun terjebak di sana oleh air pasang Toichi, seorang nelayan tua yang pendiam, membawanya kembali ke dermaga dengan perahu dayungnya, dan Anna sejenak melihat rumah itu dalam kondisi baik dan cukup terang . Ketika dia kembali ke Oiwa's, Setsu memberitahunya bahwa rumah itu dulunya sudah lama kosong . Mulai malam itu, Anna bermimpi melihat seorang gadis berambut pirang di mansion, rambutnya disisir oleh seorang wanita tua . Pada malam festival Tanabata, Anna berkelahi dengan Nobuko Kadoya karena birunya yang Anna tidak dapat jelaskan karena dia tidak tahu siapa keluarga kandungnya . Saat dia melarikan diri, dia menemukan perahu dayung di tepi pantai dan mendayungnya melintasi rawa menuju mansion, di mana dia bertemu Marnie, gadis pirang . Anna memberi tahu Marnie tentang Marnie meyakinkan Anna bahwa dia tidak sedang bermimpi sekarang . Keduanya sepakat untuk merahasiakan pertemuan mereka dan mereka bertemu lagi pada malam berikutnya . Marnie mengundang Anna ke pesta di mansion yang dipenuhi tamu . Marnie menyamarkan Anna sebagai bunga lokal dia ke pesta . Saat di sana, Anna melihat Marnie berdansa dengan seorang anak laki-laki bernama Kazuhiko . Kemudian beberapa warga kota menemukan Anna tertidur di kantor pos .

Keesokan harinya, Anna kembali ke mansion, tetapi mansion tersebut tampak ditinggalkan dan bobrok lagi . Satu minggu kemudian duduk di tepi pantai membuat sketsa di buku sketsa, Anna bertemu Hisako, seorang wanita tua yang melukis gambar rawa dan rumah besar . Hisako berkomentar bahwa sketsa Anna terlihat seperti seorang gadis yang dia kenal ketika dia masih muda, dan dia dulu tinggal memberitahunya bahwa rumah itu sedang direnovasi karena seseorang akan pindah . Anna berlari ke rumah itu, di mana dia bertemu dengan seorang gadis bernama Sayaka, yang menemukan buku harian Marnie tersembunyi di laci . Buku harian itu berisi kisah pesta dengan bunga itu halaman hilang di akhir buku harian . Keesokan harinya, Marnie muncul kembali dan memberi tahu Anna tentang bagaimana orang tuanya selalu bepergian ke luar negeri, bagaimana mereka meninggalkannya di rumah besar bersama pengasuh dan dua pelayannya, dan bagaimana pengasuh dan pelayan melecehkannya. secara psikologis dan mereka biasa mengancam untuk menguncinya di silo dekat mansion . Anna menuntun Marnie ke sana di mana dia membantunya menghadapi ketakutannya, tetapi Anna bangun dan menemukan bahwa Marnie telah meninggalkannya di silo . Sementara itu, Sayaka menemukan dari buku harian Marnie, yang mencakup bagian tentang Kazuhiko dan silo pakan yang ditinggalkan di dekatnya .

Sayaka dan kakaknya menuju silo, mengira Anna mungkin ada di sana, dan menemukannya tidak sadarkan diri dan demam di sepanjang jalan . Saat dalam kondisi demam, Anna tentang dia, menghadapi Marnie yang memberi tahu Anna bahwa dia menyesal meninggalkannya dan bahwa dia tidak dapat melihat Anna lagi . Marnie memohon pengampunan Anna dan dengan sedih dia bersumpah untuk mengingat Marnie dan hal-hal yang dia lakukan untuknya, saat dia tersapu oleh sembuh dari demamnya, Sayaka menunjukkan halaman yang hilang, dan lukisan yang diberikan Hisako kepada Marnie . Mereka berbincang dengan Hisako, yang bercerita tentang kisah Marnie, bahwa dia menikah dengan Kazuhiko dan memiliki seorang putri bernama Emily, Kazuhiko meninggal karena sakit. berkomitmen ke rumah sakit jiwa dan Emily dikirim ke sekolah berasrama . Setelah Marnie dibebaskan, Emily menyalahkan Marnie karena meninggalkannya . Emily melarikan diri dan memiliki seorang putri sendiri, tetapi dia dan suaminya tewas dalam kecelakaan mobil ketika putri mereka berusia satu tahunberusia setahun . Marnie membesarkan cucunya yang ditempatkan di panti asuhan, setelah kematian Marnie . Di akhir musim panas, Yoriko pergi ke kota untuk membawa pulang Anna .

Dia memberi Anna foto rumah besar itu dan mengatakan itu miliknya melihat nama Marnie tertulis di belakang, dia menyadari bahwa dia adalah putri Emily, dan cucu perempuan Marnie . Pengungkapan ini membantu membuat Anna menutup identitasnya, mata birunya yang tidak biasa dan yang paling penting, bahwa dia dicintai dan keluarga . Yoriko juga memberi tahu Anna tentang pembayaran pemerintah untuk perawatannya, namun Anna mengaku tahu tentang pembayaran tersebut tetapi sekarang tidak lagi mempedulikannya . Untuk pertama kalinya, Anna memanggil Yoriko ibunya . Di akhir kredit, Anna mengucapkan selamat tinggal padanya bertemu di kota, sebelum melihat Marnie di mansion melambaikan tangan padanya, saat Yoriko mengantar Anna pulang .