Jepang pascaperang berada pada titik terendah ketika krisis baru muncul dalam bentuk monster raksasa, dibaptis dalam kekuatan bom atom yang mengerikan . Merasa seolah-olah dia terlalu sering menipu kematian secara tidak adil, Shikishima, seorang pilot Kamikaze yang masih hidup, diserang di Pulau Odo bersama dengan banyak insinyur pesawat perang oleh monster raksasa . Setelah para insinyur mati karena Shikishima gagal mengalihkan perhatian monster itu, sebuahrasa bersalah yang sangat besar membebani dirinya, terutama setelah seorang wanita tunawisma dan seorang bayi pindah ke rumahnya ketika dia kembali . Shikishima, yang sekarang menjalankan misi pribadi, bekerja sama dengan sekelompok besar veteran untuk akhirnya mengalahkan monster yang dikenal sebagai Godzilla . Dihantui oleh kengerian Perang Dunia II, pilot kamikaze yang diliputi rasa bersalah, Koichi, kembali ke rumah untuk menemukan Tokyo yang hancur . Sekarang dicap sebagai pengecut, Koichi mencoba untuk bangkit kembali, namun tantangan destruktif lainnya menanti dia dan negaranya . Dengan perdamaian baru yang rapuhtergantung pada seutas benang, Koichi punya satu kesempatan terakhir untuk memperbaiki kesalahan dan membersihkan namanya sebelum monster atom yang tak terhentikan menyerang Ginza . Tapi raksasa yang bermutasi itu tidak bisa dihancurkan .

Bisakah manusia fana yang penakut menentang Godzilla, raja monster?—Nick Riganas Pada tahun 1945, menjelang akhir Perang Dunia II, pilot kamikaze Koichi Shikishima (Ryunosuke Kamiki) mendaratkan Mitsubishi A6M Zero miliknya untuk diperbaiki di pangkalan Jepang di Pulau Odo . Para mekanik tidak dapat menemukan kesalahan apa pun pada mesin atau saluran bahan bakar pesawat. sendiri adalah sebuah pulau kecil dan berada di antah berantah serta memiliki permukaan pendaratan yang hampir tidak rata, yang berarti Shikishima sangat ingin mendarat di sana . -- Mekanik utama Sosaku Tachibana (Munetaka Aoki) menyimpulkan bahwa Shikishima berpura-pura mengalami masalah teknis untuk melarikan diri dari tugasnya Saat Shikisima duduk di dekat air, dia melihat ikan laut dalam di permukaan . -- Malam itu, Godzilla, makhluk besar mirip dinosaurus yang familiar bagi penduduk setempat, menyerang garnisun . Tachibana menyuruh Shikishima untuk menembak monster itu dari miliknya berhasil masuk ke pesawatnya, yang senjatanya mengarah langsung ke Godzilla . Tapi dia panik, gagal menembak, dan pingsan . Godzilla menyerang pangkalan dan tentaranya dan menciptakan kekacauan . Senjata kecil dengan tentara tidak cukup dekat untuk Godzilla . Godzilla bahkan menghancurkan pesawat Shikisima . Ketika Shikisima terbangun keesokan harinya, dia menemukan Tachibana adalah satu-satunya yang selamat, yang marah padanya karena gagal bertindak .

Pada bulan Desember 1945, Shikishima kembali ke rumah dan menemukan orang tuanya terbunuh di pemboman Tokyo . Kota itu sendiri dilalap api dan sekarang menjadi reruntuhan . Diganggu oleh rasa bersalah orang yang selamat, ia mulai mendukung seorang wanita, Noriko Oishi (Minami Hamabe), yang orang tuanya juga tewas dalam pemboman tersebut, dan seorang bayi yatim piatu, diselamatkan . Ibu Akiko meminta Noriko untuk merawatnya . -- Sumiko adalah tetangga Shikisima dan mengatakan kepadanya bahwa sudah terlambat untuk berperan sebagai pahlawan . Ketika Sumiko mengetahui bahwa seorang gadis yatim piatu terlibat, dia membantu Noriko dan Shikishima nasi putih ke Shikisima untuk membuat bubur bagi bayinya . Pada bulan Maret 1946, Shikisima mendapatkan pekerjaan di kapal penyapu ranjau yang bertugas membuang ranjau laut dari Perang Dunia II . Pekerjaan tersebut menawarkan banyak uang, karena pekerjaan tersebut berisiko dengan kemungkinan nyata momen . Tambang magnet Amerika adalah yang paling ditakuti . Jepang tidak memiliki peralatan khusus untuk menangani 60.000 ranjau dan mengerahkan 2 kapal tunda yang telah diubah untuk pekerjaan itu . Kapal tunda kayu tidak akan menarik tambang magnet . Noda bekerja dengan Shikisima dikapal tunda . Kapal tunda membawa pemotong yang memotong tambatan tambang ke dasar laut . Ketika tambang mengapung ke permukaan, mereka diledakkan dengan senjata 13 mm . Yoji (Kuranosuke Sasaki) adalah kaptennya .

Perlahan, Shikisima cukup menyelamatkan rumah . Noriko mendapatkan pekerjaan di Ginza . -- Pada bulan Juli 1946, Godzilla dimutasi dan diberdayakan oleh Amerika Serikat' uji coba nuklir di Bikini Atoll; kapal selam yang bersentuhan dengan makhluk itu memiliki tanda-tanda radioaktivitas) dan menghancurkan beberapa kapal lain (seperti USS Lancaster) dalam perjalanan ke Jepang . Karena ketegangan dengan Uni Soviet, U . S . tidak menawarkan bantuan kecuali beberapa kapal yang dinonaktifkan Kapal Angkatan Laut Jepang disetujui oleh Jenderal Douglas MacArthur . Pemerintah Jepang, karena khawatir akan menimbulkan kepanikan, tidak memberi tahu masyarakat tentang bahaya tersebut . Pada bulan Mei 1947, Shikishima dan awak kapal penyapu ranjaunya melakukan perjalanan ke Kepulauan Ogasawara dan ditugaskan untukmenghentikan pendekatan Godzilla ke Jepang . Para kru menyaksikan Godzilla yang jauh lebih besar menarik kapal tunda ke-2 dengan mudah . Kapal tunda Shikishima menyerang Godzilla dengan ranjau dan senjata mereka tetapi berdampak kecil saat Godzilla mengejar mereka di lautan . --Mereka melepaskan ranjau ke mulut Godzilla dan meledakkannya, menyebabkan kerusakan yang signifikan, namun dengan cepat beregenerasi . Sebelum Godzilla dapat menghancurkan kapal tunda, kapal penjelajah berat Takao (dikirim dari dermaga di Singapura) kemudian menyerang Godzilla tetapi hancur ketika kapal tersebut diserang.monster mengeluarkan sinar panasnya . Setelah kembali ke Tokyo, Shikishima membuka diri kepada Noriko tentang pertemuannya dengan Godzilla .

-- Meskipun ada perintah pembungkaman, Shikishima memberi tahu Noriko tentang sejarahnya dengan Godzilla . -- Beberapa hari kemudian, Godzilla mendarat di Jepang danmenyerang Ginza, tempat Noriko bekerja . Dia nyaris selamat dari serangan awal di jalur kereta bawah tanah dan bersatu kembali dengan Shikishima (yang datang untuk menyelamatkannya) . Marah oleh tembakan tank, Godzilla melenyapkan sebagian besar distrik dengan sinar panasnya, menewaskan puluhan ribu orang Noriko mendorong Shikishima ke tempat aman namun terjebak dalam ledakan dan dianggap tewas . Hancur karena kehilangan tersebut, Shikishima bersumpah akan membalas dendam . 30.000 orang tewas dalam serangan itu . 20.000 rumah dan bangunan hancur . Frustasi karena kelambanan pemerintah, salah satunyakru kapal penyapu ranjau, mantan insinyur angkatan laut Kenji Noda (Hidetaka Yoshioka), menyusun rencana untuk menghancurkan Godzilla dengan memancingnya ke Teluk Sagami (yang kedalamannya 1500 meter) sebelum mengelilinginya dengan tank Freon dan menghancurkannya, menurunkan air' menenggelamkannya, membiarkan tekanan air yang dihasilkan menghancurkannya . Jika rencana tersebut gagal, balon akan dipompa di bawah Godzilla untuk memaksanya kembali, membunuhnya melalui dekompresi eksplosif . Hotta (Miou Tanaka) adalah kepala gugus tugas yang bekerja di bawah Noda upaya yang dipimpin oleh warga negara, karena angkatan bersenjata Jepang tidak ada, dan AS tidak akan mendukung Jepang, karena perang dingin yang terus berlanjut dengan Rusia .

Untuk melaksanakan rencananya, Noda telah merekrut veteran angkatan laut untuk menjadi awak kapal perusak IJN yang dilucuti (yang direncanakan PBB) . Shikishima merekrut Tachibana untuk memperbaiki pesawat tempur Kyushu J7W Shinden yang rusak . Shinden adalah prototipe yang tidak pernah dikerahkan dalam perang tetapi merupakan pesawat paling bermanuver di Jepang . Tachibana diperlukan karena pesawat tersebut berkarat di hanggar membutuhkan mekanik retak untuk membuatnya layak terbang . Tachibana mengisi pesawat dengan 2 bom dan senapan mesin . -- Dia berencana membunuh Godzilla dalam serangan bunuh diri dengan terbang ke mulutnya dan meledakkan bahan peledak di dalamnya . Dia meninggalkan Akiko di dalam tetangga Sumiko (Sakura Ando) sebelum Godzilla muncul kembali . Noda mendapat laporan pergerakan Godzilla's menuju Tokyo dan menghitung bahwa Godzilla akan mencapai Teluk Sagami pada jam 11 pagi keesokan harinya . Tapi Godzilla lebih cepat dari yang diperkirakan dan sudah melintasigaris pantai . -- Shikishima menyerang dengan pesawatnya dan memancing Godzilla ke perangkap yang dibuat oleh dua kapal perusak . Sumiko menerima telegram yang ditujukan untuk Shikishima . Godzilla selamat dari terjun awal dan kemudian membebaskan diri sebelum dipaksa kembali ke atas, mengalami kerusakan seriuscedera akibat Barotrauma yang disebabkan oleh dekompresi .

Dengan bantuan armada kapal tunda yang diorganisir oleh Mizushima, rekan awak kapal penyapu ranjau lainnya, kapal-kapal tersebut menyeret Godzilla ke permukaan . -- Marah, Godzilla bersiap untuk menghancurkan semua kapal dengansinar panasnya, tapi Shikishima menabrakkan pesawat ke mulut Godzilla dan menghancurkan kepalanya, menyebabkan energi sinar panas merobek tubuhnya . Para kru merayakan saat Shikishima melontarkan diri sebelum ledakan dan terjun payung ke tempat aman, menggunakan kursi lontar Tachibana dipasang di Shinden, memohon padanya untuk melepaskan rasa bersalahnya dan terus hidup . Sekembalinya ke rumah, Sumiko memberi Shikishima telegram, yang membawanya ke rumah sakit di mana dia bertemu kembali dengan Noriko, yang selamat dari kehancuran tetapi memiliki memar hitam.merayap di lehernya . Sementara itu, sepotong daging Godzilla mulai beregenerasi saat tenggelam ke laut .