Deadpool ditawari tempat di Marvel Cinematic Universe oleh Time Variance Authority, namun malah merekrut varian Wolverine untuk menyelamatkan alam semestanya dari kepunahan . Wade Wilson yang lesu bekerja keras dalam kehidupan sipil dengan hari-harinya sebagai tentara bayaran yang fleksibel secara moral, Deadpool, di belakangnya . Tapi ketika kampung halamannya menghadapi ancaman nyata, Wade dengan enggan harus menyesuaikan diri lagi dengan Wolverine yang bahkan lebih enggan . Dalam cerita multiverse ini Deadpool didekati oleh seorang pria bernama Paradox yang bermaksud untuk menguapkan seluruh alam semesta karena tampaknya tidak seharusnya hidup tanpa pahlawan Wolverine yang sekarang sudah meninggal . Deadpool menculik Wolverine versi lain untuk menggantikannyatapi ini hanya mengakibatkan Paradox membuang Deadpool dan Wolverine . Eksistensi damai Deadpool runtuh ketika Time Variance Authority merekrutnya untuk membantu menjaga multiverse . Dia segera bersatu dengan calon temannya, Wolverine, untuk menyelesaikan misi dan menyelamatkan dunianya dari ancaman eksistensial . Wade Wilson meninggalkan jubah Deadpool, menjalani kehidupan sipil normal dan juga mendapat pekerjaan di agen mobil bekas, tetapi ketika dia didekati oleh seorang pria bernama Paradox, dari Time Variance Authority, dia menawarkan Wade untuk bergabung dengan Deadpool.

saat Wade mengetahui bahwa Paradox ingin menghilangkan Timeline-nya, dia bersiap lagi dan memulai perjalanan komedi dan tawa saat dia melakukan perjalanan Multiverse untuk menemukan versi alternatif Wolverine, yang direkrut Deadpool untuk meyakinkannya membantu Deadpool menyelamatkannya.Garis waktu dari ancaman eksistensial yang dihadapinya . Saat itulah Deadpool mempelajari sifat sebenarnya dari kepahlawanan; Pada tahun 2018, Wade Wilson menggunakan perangkat penjelajah waktu Cable untuk melakukan perjalanan dari garis waktunya, Earth-10005, ke Earth-616, "Sacred Timeline", di mana dia bertemu Happy Hogan dan meminta untuk bergabung dengan Avengers, tapi dia ditolak. tentara bayaran bertopeng yang dikenal sebagai Deadpool dan mulai bekerja sebagai penjual mobil bekas setelah putus dengan pacarnya Vanessa Carlysle . Selama pesta ulang tahunnya, Time Variance Authority (TVA) menangkap Wade dan membawanya ke Mr . Paradox, yang menawarinya tempat Earth-616 . Namun, Paradox juga mengungkapkan bahwa garis waktu Wade memburuk akibat kematian James "Logan" Howlett, yang diturunkan menjadi "jangkar makhluk ." garis waktu. Wade mencuri Paradox's untuk menyelamatkan garis waktunya . Setelah menghadapi berbagai varian Logan, Wade membawa satu kembali ke TVA, di mana dia mengetahui bahwa Logan khusus ini menghancurkan alam semestanya sebelum Paradox memangkas mereka berdua ke dalam Void .

Wade dan Logan bertarung sebelum mereka dan Johnny Storm dikalahkanditangkap dan dikirim ke Cassandra Nova, yang diidentifikasi Logan sebagai saudara kembar pemimpin X-Men Charles Xavier . Setelah tiba di sarang Nova, dia menunjukkan kekuatannya untuk memanipulasi pikiran orang dan menjelaskan persetujuannya dengan TVA untuk tetap tinggal pemimpin geng . Dia kemudian membunuh Johnny dan mencoba membingungkan Wade dengan perasaan tidak dibutuhkan sebelum Alioth muncul . Wade dan Logan melarikan diri sebelum Alioth dapat memakan mereka . Setelah pelarian mereka, Logan dan Wade bertemu dengan varian Wade, Nicepool, yang memberi mobil sehingga mereka dapat melakukan perjalanan ke perbatasan Void untuk bergabung dalam perlawanan melawan Nova dan pasukannya, tetapi Logan menghukum Wade karena menyembunyikan fakta bahwa dia tidak yakin dapat memperbaiki garis waktu Logan . Tiba di perbatasan anggota perlawanan Elektra Natchios, Blade, Remy LeBeau, dan X-23, dijuluki "Lainnya" oleh Wade . Yang Lain ingin bekerja sama dengan Wade dan Logan untuk melawan Nova, tetapi Logan menolak untuk bekerja sama . Namun, dia akhirnya mengalah setelah a ketidakmampuan untuk menyelamatkan X-Men di alam semestanya . Wade, Logan, dan yang Lainnya pergi untuk menghadapi Nova, yang membuat Logan lumpuh secara mental, tetapi Wade memasang helm Juggernaut padanya untuk memblokir kekuatannya . Pyro menembak Nova dan mengungkapkan dirinya sebagai ditugaskan untuk membunuhnya .

Logan membujuk Wade untuk melepas helmnya agar Nova dapat menyembuhkan, dan sebagai gantinya, Nova menggunakan cincin selempang dari varian Doctor Strange untuk membuka portal bagi keduanya untuk melakukan perjalanan ke garis waktu Wade . Setelah tiba bahwa Paradox menggunakan "Time Ripper," sebuah perangkat yang dikembangkan Paradox untuk mengampuni ketepatan waktu, dan yang dia rencanakan untuk digunakan pada garis waktu Wade' tanpa izin dari atasannya . Nova dengan cepat mengetahui hal ini dari Pyro yang dieksekusi saat dia tiba melalui yang lain menculik Paradox . Wade dan Logan bertarung melawan Deadpool Corps, pasukan varian Deadpool yang datang dari portal, sebelum Nova mengambil kendali Time Ripper untuk menghancurkan semua ketepatan waktu sebagai balas dendam atas pengkhianatan Paradox . Paradox memberi tahu Wade dan Logan bahwa seseorang bisamengganggu aliran kekuatan Time Ripper dengan mengorbankan nyawa mereka . Menggunakan tubuh mereka sebagai konduktor, Wade dan Logan membunuh Nova dan menghancurkan Time Ripper, tetapi tetap hidup . Hunter B-15 menangkap Paradox . Yang Lain dikembalikan ke masing-masing Permintaan Wade, sementara Logan diizinkan untuk tetap berada di garis waktu Wade, yang tidak lagi memburuk .

Logan berharap untuk perubahan di masa lalunya, tetapi B-15 mengatakan kepadanya bahwa masa lalunya adalah apa yang membuatnya menjadi jangkar yang diperlukan untuk menyelamatkan berubah .Logan memilih pensiun dan hidup damai.Sebelum keberangkatannya, Wade mengajak Logan dan Laura bertemu teman-temannya .Didorong oleh Logan, Wade rujuk dengan Vanessa.