Yugi, Jaden, dan Yusei harus melakukan perjalanan melintasi waktu dan bekerja sama untuk menyelamatkan permainan kartu anak-anak . Setelah melewati batas waktu, Yusei Fudo (yang kartu kuatnya baru saja dicuri oleh orang asing misterius) bertemu dengan Jaden Yuki dan Yugi Muto, yang setuju untuk membantu Yusei mengalahkan Paradox jahat, yang berencana menghancurkan Pegasus sebelum dia . —Jaringan Berita Anime Yusei sedang bermain permainan kartu di sepeda motor ketika seorang pria bertopeng muncul dan mencuri Stardust Dragon miliknya . Dengan kekuatan Naga Merah, dia melakukan perjalanan kembali ke masa lalu ke tempat Jaden diserang oleh pria bertopeng yang sama . Pria bertopeng itu melarikan diri, Yusei memutuskan Jaden selama sisa film dan mereka berangkat ke masa Yugi Mutou . Yugi dan Kakeknya berada di tontonan paling gay di dunia ketika mereka tiba-tiba diserang oleh naga . Semua orang kecuali Yugi terbunuh, dan Yugi mencoba mendapatkan uang kembali ke waktu sekitar lima menit sebelum serangan . Dia diperkenalkan dengan Yusei Fudo, yang serius dengan suara yang membuat para fangirl pingsan, dan Jaden Yuki, yang hiperaktif lucu yang membuat orang ingin tersedak dalam tidurnya . Mereka memutuskan untuk pria bertopeng, yang namanya diturunkan menjadi Paradox .

melawan segala rintangan ketiga karakter utama menang, melalui kekuatan homo, menjadi karakter utama, waktu gaya bebas dan bola berbulu . Mereka akan berangkat ke waktu masing-masing, ketika dan ketiganya dikirim ke subruang . —greywolfkin