Bertahun-tahun setelah pemerintahan Kaisar, seekor kera muda melakukan perjalanan yang akan membawanya mempertanyakan semua yang telah diajarkan kepadanya tentang masa lalu dan membuat pilihan yang akan menentukan masa depan kera dan manusia . Film Apes yang baru berlatar waktu bertahun-tahun setelah berakhirnya Perang untuk Planet Kera pada tahun 2017. Banyak komunitas kera telah berkembang sejak Kaisar yang mirip Musa membawa umatnya ke oasis, sementara manusia menjadi liar. kelompok belum pernah mendengar tentang Caesar, sementara yang lain telah memutarbalikkan ajarannya untuk membangun kerajaan yang sedang berkembang . Dalam situasi ini, salah satu pemimpin kera mulai memperbudak kelompok lain untuk menemukan teknologi manusia, sementara kera lain, yang menyaksikan klannya direbut, memulai perjalanan menemukan kebebasan . Seorang wanita muda menjadi kunci dalam pencarian kebebasan, meskipun dia memiliki rencananya sendiri . Berlatar beberapa generasi di masa depan setelah pemerintahan Kaisar, di mana kera adalah spesies dominan yang hidup secara harmonis dan manusia terpaksa hidup dalam bayang-bayang . Saat pemimpin kera tirani baru membangun kerajaannya, seekor kera muda melakukan hal yang mengerikanperjalanan yang akan menyebabkan dia mempertanyakan semua yang telah dia ketahui tentang masa lalu dan membuat pilihan yang akan menentukan masa depan bagi kera dan manusia .

—Pedro Borges Beberapa generasi setelah kematian Caesar, kera telah membentuk banyak klan, sementara sebagian besar manusia menjadi liar. . Noa, seekor simpanse muda dari klan yang berlatih elang, bersiap untuk upacara kedewasaan dengan mengumpulkan telur elang bersamanya. Soona . Namun, seorang pemulung manusia mengikuti Noa pulang dan secara tidak sengaja memecahkan telurnya selama perkelahian sebelum melarikan diri . Saat mencari telur pengganti, Noa bertemu dengan sekelompok perampok kera yang menggunakan senjata listrik . Saat Noa bersembunyi dari mereka, para kera mengikutinyakuda kembali ke klannya . Noa bergegas pulang dan menemukan desanya terbakar; menyelamatkan klannya . Dalam perjalanannya, ia bergabung dengan Raka, seekor orangutan yang memberi tahu Noa tentang ajaran Caesar . Kera menyadari bahwa mereka diikuti oleh manusia pemulung; manusia liar, perampok Sylva tiba-tiba menyerang . Noa dan Raka menyelamatkan Nova yang, secara mengejutkan, dapat berbicara . Dia mengungkapkan bahwa namanya adalah Mae dan bahwa para perampok membawa klan Noa ke pemukiman tepi pantai di luar gudang manusia tua . Dalam perjalanan ke pemukiman, mereka disergap oleh Sylva . Dalam pertarungan berikutnya, Raka menyelamatkan Mae dari tenggelam tetapi tersapu oleh jeram . Noa dan Mae ditangkap dan dibawa ke pemukiman kera' . Noa bersatu kembali dengan klannya dan diperkenalkan memproklamirkan diri sebagai raja, Proximus Caesar .

Proximus telah memperbudak klan lain, memaksa mereka bekerja membuka brankas sehingga dia dapat mengakses teknologi manusia yang terkunci di dalamnya . Proximus mengundang Noa untuk makan malam bersama Mae dan Trevathan, seorang tahanan manusia yang sedang mengajarProximus tentang dunia manusia lama . Proximus percaya bahwa kecerdasan Noa dapat membantu membuka brankas dan memperingatkannya bahwa Mae hanya memiliki agendanya sendiri . Noa mengonfrontasi Mae, menuntut kebenaran sebagai imbalan atas bantuannya . Mae mengungkapkan pengetahuan tentang pintu masuk yang tersembunyi lemari besi dan mengatakan bahwa sebuah "buku" misterius yang mampu memulihkan ucapan umat manusia ada di dalam . Noa setuju untuk membantunya memasuki lemari besi, berharap untuk menghancurkan pemukiman Proximus' dan memimpin klannya kembali ke rumah . Noa, Mae, Soona, dan Anaya diam-diam tanggul yang mengelilingi pemukiman . Trevathan menangkap mereka dan bermaksud memperingatkan Proximus, tapi Mae mencekiknya sampai mati . Kelompok tersebut memasuki lemari besi, menemukan tumpukan senjata dan "buku" Mae, yang sebenarnya adalah kunci penguraian satelit . buku bergambar anak-anak yang menggambarkan manusia sebagai spesies yang dulunya dominan dan kera di dalam kandang di kebun binatang . Saat kelompok tersebut keluar dari bunker, mereka dihadang oleh Proximus dan sukunya .

Lightning, salah satu letnan' Proximus, mengancam Mae membunuhnya dengan pistol yang dia temukan sebelum memicu bahan peledak, membanjiri bunker dengan kera di dalamnya . Mae melarikan diri dari pemukiman sementara kera naik ke tempat yang lebih tinggi melalui bunker . Noa dikejar oleh Sylva, tetapi berhasil menjebak dan menenggelamkannya . melarikan diri dari bunker bersama klannya, tetapi Proximus menyerangnya . Noa memimpin klannya memanggil elang mereka untuk menyerang Proximus dan mengirimnya jatuh dari tebing ke laut . Saat klan Noa kembali untuk membangun kembali rumah mereka, Mae datang untuk menawar dengan tegang menjelaskan bahwa dia menghancurkan bunker dan mencegah kera mengakses senjatanya karena diciptakan oleh manusia dan karenanya hanya boleh digunakan oleh manusia . Noa kemudian berpendapat bahwa jika senjata dan teknologi hanya untuk manusia, itu menunjukkan bahwa tidak ada yang menjadi milikkera, mempertanyakan apakah kera dan manusia dapat hidup berdampingan secara damai mengingat perbedaan mendasar Mae' . Saat Noa mengajak Soona untuk melihat melalui teleskop yang dia temukan dalam perjalanannya, Mae melakukan perjalanan ke pemukiman manusia di pangkalan satelit, yang dikarantina dunia luar . Mae mengirimkan kunci pengurai, memungkinkan manusia mengaktifkan kembali satelit dan berhasil menghubungi manusia lain di seluruh dunia .