G . I . Joes tidak hanya melawan musuh bebuyutan mereka, Cobra; Joes kembali bekerja sama untuk mencegah Cobra mencapai dominasi dunia total dalam sekuel ini yang terjadi tak lama setelah peristiwa G . I . Joe: The Rise of Cobra . Ancaman Nanomite telah dinetralisir, dan pemerintah AS telah Hancurkan di penjara bawah tanah yang tak terhindarkan . Ketika pemimpin Pakistan dibunuh, presiden AS . (Jonathan Pryce) meminta Joes untuk mengamankan hulu ledak nuklir Pakistan sebelum jatuh ke tangan musuh . Setelah berhasil menyelesaikan misi merekamisi, namun, Joes hancur dalam serangan mendadak yang menghancurkan . Ketika asap hilang, Roadblock (Dwayne Johnson), Lady Jaye (Adrianne Palicki), dan Flint (D . J . Cotrona) adalah satu-satunya yang selamat . Mereka'yakin House, dan ketika Lady Jaye berteori bahwa seorang penipu berpura-pura menjadi panglima tertinggi, orang-orang jahat Storm Shadow (Lee Byung-Hun) dan Firefly (Ray Stevenson) bekerja sama untuk membebaskan Komandan Cobra (Luke Bracey) dari penjara .

Nanti pegunungan untuk pulih dari luka bakar yang terjadi dalam ekstraksi, Snake Eyes (Ray Park) dan Jinx (Elodie Yung) berhasil menangkap ninja putih yang sulit ditangkap, dalam proses menemukan rahasia mengejutkan tentang masa lalunya dan mengetahui bahwa Zartan (Arnold Vosloo), berpose presiden, telah mengadakan pertemuan puncak internasional untuk membahas perlucutan senjata nuklir untuk membuat para pemimpin dunia bertekuk lutut di hadapan Komandan Cobra yang kejam . Sekarang, ketika Cobra menyandera seluruh dunia dengan senjata baru yang revolusionersatelit yang mengorbit planet ini, terserah kepada Joes dan teman lama yang dapat dipercaya untuk menyelamatkan hari . . Setelah misi sukses di wilayah internasional, G . I . Joes terlambat menyadari bahwa tugas mereka berikutnya diatur oleh musuh bebuyutan mereka, Cobra, yang telah berhasil menyusup ke pemerintah AS . Zartan menyamar sebagai Presiden dan orang-orang jahatKomandan Cobra membuat para pemimpin dunia bertekuk lutut sebagai bagian dari rencana jahatnya untuk meluncurkan rudal nuklir ke negara-negara yang tidak bersalah . Menjadi satu-satunya Joe yang selamat dalam serangan mematikan, Roadblock, Flint, dan Lady Jaye harus merekrut Jenderal Joe Colton yang legendaris untukmembantu mereka mengungkap plot Cobra dan menyelamatkan dunia dari kehancuran total . —Blazer346 Tim G .I .

Joe dijebak atas kejahatan terhadap negara oleh Zartan, yang menyamar sebagai Presiden, dan Komandan Cobra memiliki semua pemimpin dunia di bawah pengaruhnya, dengan hulu ledak canggih mereka menuju ke masyarakat tak berdosa di seluruh dunia . Kalah jumlah dankalah persenjataan, anggota tim yang masih hidup membentuk rencana dengan pemimpin asli mereka, Jenderal Joseph Colton, untuk menyelamatkan Presiden dan menghadapi Komandan Cobra, kaki tangannya, dan para pemimpin dunia . —Anonymous Militer AS menerima informasi bahwa Presiden Pakistan telah meninggal, dan persenjataan nuklir mereka berisiko jatuh ke tangan teroris . -- Keluarga Joe ditugaskan untuk mengamankan hulu ledak nuklir dari Pakistan oleh Zartan (Arnold Vosloo) yang menyamar sebagaiPresiden Amerika Serikat (Jonathan Pryce) . Tim melakukan tugas dan mengamankan nuklir . Mereka mundur ke pangkalan depan menunggu ekstraksi . -- Seluruh tim tersingkir dalam serangan militer, dengan Duke (Channing Tatum) sebagai salah satu dari mereka Penghalang Jalan (Dwayne Johnson), Flint (D . J . Cotrona) dan Lady Jaye (Adrianne Palicki) adalah satu-satunya yang selamat . -- Penghalang jalan berspekulasi bahwa serangan terhadap Joes hanya bisa diperintahkan oleh POTUS . Mereka menemukan lapangan terbang di padang pasir kembali ke AS .

POTUS menyalahkan GI Joes karena membunuh Presiden Pakistan (diduga dibunuh oleh Snake Eyes) mencuri senjata nuklir untuk tujuan mereka sendiri dan mencap mereka sebagai pengkhianat . -- POTUS mengadakan pertemuan semua kekuatan besar dunia untuk membahasperlucutan senjata nuklir . Sementara itu, Storm Shadow (Byung-Hun Lee) dan mantan Joe Firefly (Ray Stevenson) menyelamatkan Komandan Cobra (Luke Bracey) dari penjara bawah tanah dengan keamanan maksimum di Jerman . Storm Shadow terluka saat melarikan diri, dan mundur ke Himalaya akan pulih . -- Sementara itu, Komandan Cobra mengawasi kemajuan Proyek Zeus . Cobra berencana meluncurkan Zeus dalam 48 jam . Setelah mengetahui bahwa dia masih hidup, Master Buta (RZA), pemimpin Klan Arashikage, mengirimkan Mata Ular (Ray (Elodie Yung), sepupu Storm Shadow, untuk menangkap Storm Shadow sehingga dia bisa bertanggung jawab atas pembunuhan pamannya, Hard Master . -- Blind Master memberitahu Jinx untuk menemukan kedamaian batinnya, jika dia ingin menjadi hebat Amerika Serikat di mana mereka mendirikan basis operasi di gym kumuh . -- Setelah Zartan mengumumkan bahwa Cobra akan menggantikan Joes sebagai unit pelindung utama Amerika, Lady Jaye menyimpulkan bahwa seseorang menyamar sebagai Presiden . Dia telah menganalisis masa lalu dan masa kinirekaman POTUS dan menemukan beberapa perubahan tingkah laku yang menunjukkan cukup keraguan bahwa POTUS asli telah diganti dengan penipu .

-- Penghalang jalan membawa mereka ke Jenderal Joseph Colton (Bruce Willis), yang memberi mereka senjata dan membantu mereka menyusup ke dalamacara penggalangan dana yang akan dihadiri Presiden . -- Lady Jaye mencuri sampel DNA Presiden dan mengonfirmasi bahwa dia adalah Zartan . Mereka melarikan diri setelah konfrontasi singkat dengan Firefly dan Zandar (Matt Gerald), kepala kantor anggota Cobra . Mata Ular dan Jinx mencari dan menangkap Storm Shadow di biara gunung tempat dia memulihkan luka-lukanya . Setelah pertempuran dengan beberapa ninja yang setia pada Storm Shadow dan membawanya kembali ke Tokyo, di mana Storm Shadow menyatakan bahwa dia tidak melakukannyamembunuh Hard Master dan membuktikannya dengan melawan Snake Eyes dengan senjata yang membunuh Hard Master, yang pecah karena itu bukan baja Arashikage . -- The Blind Master menyimpulkan bahwa Zartan adalah orang yang membunuh Hard Master dan menjebak Storm Shadow bergabung dengan Cobra untuk menjatuhkannya dari dalam . Dibebaskan, Storm Shadow menemani Snake Eyes dan Jinx, sepupunya, saat mereka bergabung dengan upaya Joe' untuk menghentikan Cobra dan membalaskan dendam Hard Master . Zartan mengundang para pemimpin dunia ke pertemuan puncak, di mana dia melumpuhkan persenjataan nuklir mereka .

Dia menembakkan semua hulu ledak nuklir AS, memaksa negara lain melakukan hal yang sama, dan kemudian ketika semua nuklir sudah mengudara, dia menghancurkan sendiri nuklir AS, mendorong negara lain melakukan hal yang sama . Dalam satu pukulan, -- Zartan mengungkapkan bahwa dia telah menciptakan Proyek Zeus: tujuh senjata pemboman kinetik orbital pemusnah massal di bawah komandonya . -- Dia menghancurkan pusat kota London untuk membuktikan keunggulannya dan mengancam akan menghancurkan ibu kota lain jika negara-negara tersebut tidak tunduk pada Cobra .Namun, Storm Shadow mengkhianati Komandan Cobra dan membunuh Zartan, mengungkapkan penipuan Cobra kepada para pemimpin dunia . Sementara Snake Eyes, Jinx, dan Flint melawan tentara Cobra, Komandan Cobra mengaktifkan enam senjata yang tersisa dan menginstruksikan Firefly untuk melindungi peluncuranperangkat . -- Firefly terbunuh dalam pertempuran oleh Penghadang, yang menonaktifkan dan menghancurkan senjata orbital . Sementara itu, Colton dan Lady Jaye menyelamatkan Presiden yang sebenarnya . -- Komandan Cobra melarikan diri selama pertempuran dan Storm Shadow menghilang setelah membalas dendam pamannya .Presiden yang sebenarnya berpidato di depan bangsa pada upacara di mana Roadblock, Lady Jaye, Flint, Jinx, dan Snake Eyes diperingati sebagai pahlawan . Colton memberi hormat kepada mereka masing-masing dan menghadiahkan Roadblock pistol M1911 milik Jenderal George S . Patton, untuk digunakan ketika akhirnya menemukan Komandan Cobra .

Penghadang dengan bangga mengangkat senjatanya dan melepaskan satu tembakan untuk menghormati rekan-rekannya yang gugur .