Karena tragedi masa lalu, seseorang yang ingin membalas dendam menyembunyikan bom di arena sepak bola beberapa kali dan tugas Conan adalah menyelamatkan semua orang sekali lagi . Agen detektif Kogoro menerima panggilan telepon misterius . Seseorang di ujung sana memperingatkan tentang bom dan meninggalkan kode, "Anak Laki-Laki Berbaju Biru dan Zebra Biru, hujan dari atas . . ." Setelah itu, sebuah mobil meledak Conan bisa memecahkan teka-teki itu, dia bisa menghentikan bomnya . Petualangan dimulai untuk Conan dan Detective Boys, terjadi di pertandingan sepak bola antara Hideo Akagi dari Tokyo Spirits dan Ryusuke Higo dari Big Osaka . Conan memecahkan teka-teki pertama dan menemukan di papan skor elektronik Stadion Touto . Dia berhasil memberi tahu polisi untuk mengevakuasi para penggemar di sisi Spirits sebelum bom meledak, sehingga tidak ada korban jiwa . Namun, hanya dua minggu kemudian, surat ancaman lain dikirim ke Mouri Kogoro'skediaman, mengumumkan bahwa pembom telah memasang bom di semua stadion dan akan meledak di akhir pertandingan, kecuali kondisi tertentu terpenuhi . Kali ini, upaya evakuasi atau penjinakan bom tidak diperbolehkan . Polisi dan Conan memecahkan kode kedua danmenginformasikan kepada sepuluh penyerang tim untuk melakukan tindakan rahasia yang diminta pelakunya . Berkat itu, mereka berhasil menjinakkan bom di sembilan stadion, dan ternyata sinyal pengaktifan di Stadion Nasional tidak berfungsi .

Sementara itu, polisi yang dipimpinoleh Shiratori, menyelidiki calon tersangka, Keiichirou Motoura . Dia memiliki motif yang jelas untuk melakukan pengeboman: putranya, Tomofumi, meninggal dalam perjalanan ke rumah sakit, di mana ambulans yang membawanya diblokir oleh Mouri Kogoro selama dua menit, dan Motoura membawa balas dendam untuk putranya . Motoura, saat sedang marah pada Mouri, menyangkal bahwa dia yang memasang bom . Penjahat sebenarnya adalah Kazumasa Nakaoka . Motifnya adalah balas dendam atas kematian Tomofumi Motoura, putra pelatih sepak bola, Keiichirou Motoura . Dulu ketika dia masih sepak bola, dia bertemu Tomofumi dan keduanya menjadi teman ketika Tomofumi memohon untuk belajar sepak bola dari Kazumasa . Meskipun memiliki tubuh yang lemah, Tomofumi bersikeras untuk belajar memainkan permainan yang sangat menyentuh hati Kazumasa . Namun, setelah kecelakaan sepeda Kazumasa, yang meninggalkannyaterluka dan tidak bisa bermain, keduanya kehilangan kontak . Beberapa tahun kemudian ketika Tomofumi duduk di kelas 4 SD, keduanya bertemu lagi dengan Tomofumi bermain di tim sepak bola sekolahnya . Meskipun berhasil masuk ke tim sepak bola, Tomofumi tidak pernah berpartisipasi permainan karena tubuhnya yang lemah . Ketika dia diberi kesempatan untuk bermain selama pertandingan, Nakaoka memberinya janji bahwa keduanya akan merayakannya jika Tomofumi membuat gol, dan dia berhasil melakukannya .

Pada hari Nakaoka pergi untuk merayakannya bersama ibu bahwa Tomofumi meninggal dalam kecelakaan saat pulang dari latihan pada suatu sore . Hal ini membuatnya sangat putus asa dan setelah mengetahui dari ayah Tomofumi bahwa ambulans yang membawa Tomofumi ke rumah sakit dihentikan oleh segerombolan orang saat pertandingan sepak bolapertandingan, Kazumasa menjadi getir dan kesal . Terutama setelah mengetahui bahwa Kogoro yang mabuk adalah kepala gerombolan itu, pada saat itu dia memutuskan untuk menghabiskan beberapa tahun ke depan merencanakan balas dendam . Conan menyimpulkan bahwa Nakaoka telah memasang bom di sepuluh stadion, kecualiStadion Nasional tempat ia mencapai puncak karir sepak bolanya, memikat Kogoro ke Stadion Touto dan berencana bunuh diri bersama Kogoro . Nakaoka menunjukkan bahwa kesimpulan Conan mengandung kelemahan besar . Nakaoka menjelaskan bahwa bom juga dipasang di Stadion NasionalStadion, tetapi akan meledak pada 5 . 50, 35 menit lebih lambat dari stadion lain, dan kunci untuk menjinakkan bom di Stadion Nasional sebenarnya tetap di Stadion Touto tempat dia berdiri . Dalam salah satu teka-tekinya, dia mengungkapkan bahwa dia sedang mencari pembalasan dendam; Mitsuhiko, Genta dan Haibara, Conan berhasil menonaktifkan bom meski dirugikan . Nakaoka menyadari bahwa Conan adalah striker kesebelas yang dia cari .